Deler av Ormøya, Malmøya og Malmøykalven eies av Oslo kommune og forvaltes av Friluftsetaten. Andre arealer er i privat eie.

Områdene er fredet på grunn av at det er viktig område for fugler, og at vegetasjon og geologi er rik og særpreget.

I Solvikbukta ligger Solvik Camping som er kombinert bade- og campingplass tilrettelagt for bevegelseshemmede.

12 arter på rødlista
Kalkfuruskogen på Malmøya er blant de største og best utviklede i Indre Oslofjord. Hele 12 rødlistede plantearter, hvorav 4 sopparter, er funnet her.
 
Rike geologiske forekomster
Malmøyas geologiske betydning ble påpekt allerede i 1844 av den berømte britiske geologen R. I. Murchinson, og etter hvert ble man også klar over de verdifulle botaniske forekomstene.

Geologien her er som ei åpen historiebok, og i dag brukes Malmøya til forskning og undervisning på disse feltene.

Holmene er sjøfuglreservater
Av hensyn til fuglelivet er ilandstigning og ferdsel på Kaninøya, Malmøyskjær og Hertugskjær forbudt i deler av sommerhalvåret.

Regler for ferdsel:
Det er ikke tillatt å hakke eller på annen måte skade berggrunnen.

Telting er ikke tillatt.

Se på fossilene, men ikke ta dem med deg.

Plantelivet er fredet mot all ødeleggelse.

Det er ikke lov å plukke blomster, bryte greiner av trær og busker e.l, men plukking av bær og matsopp er tillatt.

Fuglelivet er fredet. Ikke skad eller forstyrr fugler, reir, egg eller unger.

Det er forbudt å kaste søppel.

Bål er forbudt.

Kjøring og parkering av motorkjøretøyer utenom veier og parkeringsplasser er ikke tillatt.

Det er forbudt å stige i land på Kaninøya, Malmøyskjær og Hertugskjær forbudt i deler av sommerhalvåret.

Det er forbudt utover ett døgn å forankre eller hensette båt i naturminnene og i en sone på 50 m ut fra strandkanten, unntatt for fastboendes og hytteeieres båter på egen eiendom.